1. 基本概念
TMB是指每百万个碱基中外显子编码区发生的置换、插入/缺失突变的总数,用于评估肿瘤产生新抗原的能力。高TMB(通常≥10 mut/Mb)可能预示更好的免疫治疗响应,因为突变越多,免疫系统识别和攻击肿瘤的机会越大。
2. 检测方法
样本准备:需肿瘤组织样本(tTMB)或血液样本(bTMB)。组织样本需提取肿瘤DNA,血液样本则通过循环肿瘤DNA(ctDNA)分析。
测序技术:
全外显子测序(WES):检测所有外显子区域,是TMB检测的金标准,但成本较高。
靶向Panel测序:使用经过验证的二代测序(NGS)Panel(如MSK-IMPACT),覆盖特定基因区域,与WES结果高度一致,更适合临床。
数据分析:统计突变位点数量,除以检测的外显子总长度(单位:Mb),得到TMB值(mut/Mb)。
3. 临床应用
免疫治疗预测:TMB高的患者(如黑色素瘤、肺癌)可能对PD-1/PD-L1抑制剂更敏感。
局限性:需结合其他生物标志物(如MSI、PD-L1表达),因部分TMB低的患者也可能获益。
4. 技术挑战
标准化问题:不同测序平台和Panel的覆盖范围差异可能影响TMB值,需统一阈值。
样本要求:组织样本质量或血液中ctDNA含量不足可能导致误差。
如果需要具体操作示例,可参考视频教程中提到的脚本分析和数据校正步骤。