非肿瘤生信代码非肿瘤生信分析

肿瘤治疗 2025-09-22 19:25肿瘤治疗www.zhongliuw.cn

非肿瘤生信分析是当前生物信息学领域的热门方向，相比肿瘤分析具有更广泛的疾病应用场景和较低的竞争压力。以下是非肿瘤生信分析的主要方法和代码实现要点：

1. 核心分析方法

WGCNA+机器学习：通过加权基因共表达网络分析筛选模块基因，结合LASSO回归、随机森林等算法构建诊断模型

多组学整合：整合转录组、单细胞数据和亚细胞定位信息进行系统验证

分子模拟：使用分子对接和动力学模拟验证活性小分子与靶点结合特性

2. 关键代码实现

3. 创新思路

代谢相关基因分型：基于能量代谢基因进行疾病亚型分类

铁死亡分析：在儿童脓毒症等疾病中研究铁死亡相关基因

miRNA挖掘：将肿瘤分析套路迁移到急性心肌梗死等非肿瘤疾病

4. 实用工具推荐

仙桃学术平台：零代码复现2区SCI分析流程

R包合集：DESeq2差异分析、lasso回归等常用分析工具

Deepseek：专为医学生设计的生信分析工具

建议优先选择Q1区7.7分文献的分析框架，其包含从数据下载到分子模拟的完整流程，且只需转录组和单细胞数据即可实现多维度分析。对于初学者，可从GEO数据差异分析和免疫浸润评分等基础模块入手。