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肿瘤差异表达数据库查询

抗肿瘤食物 2025-09-17 11:13抗肿瘤食物wwww.zhongliuw.cn

1. cBioPortal

  • 提供癌症基因组数据可视化分析平台，可查询基因在多种肿瘤中的突变和表达情况
  • 支持输入多个基因同时分析，展示突变频率、位点分布和生存曲线等数据

    • 2. TCGA (The Cancer Genome Atlas)

  • 包含超过20,000例原发性癌症的分子特征数据，涵盖33种癌症类型
  • 可通过GDC数据门户筛选RNA-Seq数据（如转录组分析、基因表达定量）进行差异表达研究

    • 3. dbDEMC

  • 专注于肿瘤中差异表达的miRNA，整合2224个miRNA在36种肿瘤中的表达数据
  • 支持按miRNA ID或肿瘤类型检索，提供热图展示表达谱

    • 4. GEPIA2

  • 在线分析工具，支持输入基因符号或Ensembl ID快速获取表达差异分析结果
  • 可自定义统计方法（如log2FC阈值）筛选差异表达基因

    • 5. COSMIC

  • 全球最大的体细胞突变数据库，包含拷贝数变异（CNA）、甲基化等数据
  • 突变信息来自文献手工整理，适用于癌症驱动突变

    • 6. OncoKB

  • 由MSK癌症中心维护，提供基于证据的体细胞突变治疗决策支持

    • - 包含基因在多种癌症中的突变位点分布和临床意义注释

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