肿瘤纯度什么意思 estimate肿瘤纯度
抗肿瘤食物 2025-07-07 09:29抗肿瘤食物wwww.zhongliuw.cn
肿瘤纯度(Tumor purity)是指肿瘤样本中癌细胞所占的比例,反映了肿瘤组织中非肿瘤成分(如基质细胞、免疫细胞等)的混杂程度。高纯度样本中癌细胞占比更高,而低纯度样本则含有较多非肿瘤细胞成分。
关于ESTIMATE算法计算肿瘤纯度的方法:
1. 核心原理
ESTIMATE(Estimation of STromal and Immune cells in MAlignant Tumours using Expression data)通过分析基因表达数据,识别基质细胞和免疫细胞的特征基因集(各141个基因),分别计算:
2. 应用场景
3. 与其他方法的对比
ESTIMATE的优势在于无需额外实验数据,仅需基因表达谱即可快速评估肿瘤微环境组成,但其准确性依赖于特征基因集的适用性。
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