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肿瘤疾病数据库方案肿瘤数据统计

肝癌 2025-10-26 14:08肝癌症状www.zhongliuw.cn

一、核心数据库选择

1. 综合性肿瘤数据库

  • TCGA:提供33种肿瘤类型的基因组、转录组、表观遗传及临床数据,支持分子分型和预后模型构建。
  • ICGC:覆盖50种肿瘤亚型的基因组异常数据,与TCGA互补。
  • cBioPortal:集成126个肿瘤研究项目数据,支持突变频率、生存曲线等可视化分析。
  • 2. 临床与预后数据库

  • OncoKB:基于证据的体细胞突变数据库,辅助治疗决策。
  • 国家肿瘤大数据平台:整合全国肿瘤患者的电子病历、影像、随访数据,支持临床质控与科研分析。
  • 二、数据统计流程

    1. 数据预处理

  • 清洗:处理缺失值(插值或删除)、异常值(箱线图或3σ原则)、重复数据。
  • 标准化:统一编码(如ICD-10)、单位转换,确保多源数据兼容。
  • 2. 分析方法

  • 差异分析:通过t检验等识别肿瘤与正常组织的差异基因。
  • 生存分析:利用Kaplan-Meier曲线评估患者五年生存率等预后指标。
  • AI辅助:结合机器学习预测疗效或复发风险,如中国医学科学院肿瘤医院的实时质控系统。
  • 3. 可视化工具

  • GEPIA:交互式分析基因表达与预后的关联。
  • FineBI:生成仪表盘展示数据趋势,如发病率、死亡率排名。
  • 三、实施建议

  • 多中心协作:参考骨肿瘤专病数据库模式,建立标准化数据集并共享。
  • 隐私保护:数据脱敏加密,符合规范。
  • 通过以上方案,可系统化实现肿瘤数据的采集、清洗、分析及可视化,支撑科研与临床决策。

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