肿瘤新抗原的检测通常结合基因测序技术和生物信息学分析,通过识别肿瘤细胞特异性突变产生的异常蛋白片段来实现。以下是主要检测方法和相关技术要点:
1. 基因测序与突变分析
全外显子测序(WES):对肿瘤组织和正常组织进行测序比对,识别体细胞突变(如单核苷酸变异、插入缺失等),这些突变可能编码新抗原。
RNA测序:补充WES数据,验证突变基因是否实际表达,提高新抗原预测准确性。
2. 新抗原预测与筛选
HLA分型与结合预测:通过患者的人类白细胞抗原(HLA)分型,预测突变肽段与HLA分子的结合亲和力,筛选潜在免疫原性强的候选新抗原。
免疫原性验证:实验室通过体外T细胞激活实验或质谱技术验证新抗原能否被免疫系统识别。
3. 临床应用与动态监测
治疗评估:术后或化疗期间定期检测新抗原相关标志物(如突变负荷),评估治疗效果或复发风险。
个体化疫苗开发:基于新抗原设计疫苗,激活特异性免疫反应,目前处于临床试验阶段。
4. 辅助技术整合
液体活检:通过血液检测循环肿瘤DNA(ctDNA)中的突变,间接反映新抗原动态变化。
AI辅助分析:人工智能加速新抗原筛选流程,提高预测效率,部分技术已用于癌症早筛。
注意事项
新抗原检测需结合病理学、影像学结果综合判断,单一检测可能存在假阳性/阴性。
- 目前技术成本较高,多用于研究或个体化治疗。